La biodiversité de la faune souterraine en relation avec quelques facteurs abiotiques à Awae a été étudiée dans le Département de la Mefou Afamba, Région du Centre - Cameroun. Les travaux ont été menés sur 12 mois (Janvier à Décembre 2022) dans 8 Puits choisis au hasard. Les analyses physicochimiques et biologiques ont été effectuées sur le terrain et au laboratoire suivant les méthodes standards. La faune souterraine a été collectée à l’aide d’un filet phréatobiologique de 150 µm d’ouverture de maille en toile fine monté sur un cercle métallique et les organismes ont été identifiés à l’aide des clés d’identification et d’ouvrages appropriés. Les résultats des analyses physicochimiques ont montré que ces eaux sont faiblement minéralisées (72,29 ± 66,94 µS/cm), légèrement acides (6,02 ± 0,38 UC), moyennement oxygénées (66,18 ± 20,74 %) avec une température moyenne de (25,23 ± 1,66) °C. L’ensemble des résultats physico chimiques permet de conclure que ces eaux sont écologiquement de qualité critique. Au total, 570 individus appartenant à 3 Embranchements (Arthropodes, Mollusques et Annélides), 7 Classes, 11 Ordres et 22 Genres ont été identifiés. L’embranchement des Arthropodes a été dominant avec 97,54 % de l’abondance totale et une forte représentativité des Chironomidae et des Formicidae. Les Ordres des Coléoptères et Diptères ont été les plus diversifiés avec 10 taxa chacun. La structure de la faune révèle une communauté faiblement diversifiée et équidistribuée. La stygofaune dominée par les Diptères (47%), les Hyménoptères (31%) et les Coléoptères (8%), indique une dégradation de la qualité des eaux. Ces eaux utilisées par les populations pour des besoins domestiques nécessitent un traitement préalable. La construction de ces ouvrages d’approvisionnement domestique en eau devrait respecter les normes, ce qui limiterait substantiellement la contamination des eaux.