Le présent travail porte sur l’évaluation de la qualité écologique de l’eau du lac Djetoè dans la commune de Lokossa (Benin). Il a pour objectifd’évaluer la qualité de l’eau du point de vue physico-chimique et biologique pour connaître le niveau actuel de pollution. La démarche méthodologique s’est déroulée en trois phases : la recherche documentaire, les travaux de collecte de données de terrain et d’analyse au laboratoire. Les paramètres in situ (pH, température, conductivité) ont été mesurés à l’aide d’un multi paramètre YSI Pro-2030-professional Series ; la méthode spectrophotométrique a été utilisée pour les analyses physico-chimiques (Nitritres, nitrates, ammonium, ortophosphates, etc.) et le phytoplancton a été échantillonné via un filet à plancton de maille 20 µm, dénombré et observé à l’aide du microscope photonique de marque VWR puis identifié à l’aide des clés d’identification. Les résultats des analyses physico-chimiques ont montré que les eaux présentent une température élevée et des teneurs élevées en nitrite et phosphore total mais polluée en ammonium. Quant aux paramètres biologiques, ils révèlent une grande diversité d’espèces dans le lac avec une dominance des euglenophycées (28,81 %). Les chlorophycées, les diatomées, les cyanophycées, les chrysophycées, les cryptophycées, les dinoflagellés, les xanthophycées et les zygophycées ont été également retrouvées sur les différents sites avec des valeurs respectives tels que 20,34 % ; 18,64 % ; 10,17% ;6,78 % ; 3,39 % ; 3,39 % ; 6,78% ; 1.69%. Le genre phacuset euglenaest le plus rencontré chez les euglenophycées. La corrélation entre l’abondance des espèces et les paramètres physico-chimiques montre à travers la matrice de Pearson que les euglenophycées sont corrélés par les nitrites, l’ammonium et l’orthophosphate quant aux chlorophycées ils sont uniquement corrélés par l’oxygène. En conclusion, pour assurer une gestion durable du lac, il serait souhaitable que des dispositions soient prises par les autorités communales afin d’assurer le bon fonctionnement écologique de ce cours d’eau.