La présente étude a pour objectif d’identifier les valeurs naturelles associées aux aires protégées du Burundi et d‘apprécier l’impact des mesures de conservation. Les données ont été collectées au moyen d’une enquête qualitative auprès des gestionnaires des aires protégées, des représentants de l’administration (communale et collinaire) et des populations riveraines à ces aires protégées. Ces données ont été soumises au calcul des proportions pour des analyses comparées des perceptions des différentes catégories de répondants selon les modalités des variables valeurs naturelles associées à l’aire protégée (espèces végétales clés, espèces animales clés, milieu particulier) et impact de la conservation (les espèces ont augmenté, les espèces sont en nombre presque identique, le nombre d’espèces a régressé, la qualité du milieu est améliorée). Les résultats sur les valeurs naturelles montrentque toutes les catégories de répondants notent globalement la présence des espèces végétales et animales clés dans les aires protégées burundaises. Les résultats de l’appréciation de l’impact de la conservation ont montré que seuls les gestionnaires des aires protégées reconnaissent que le nombre d’espèces a régressé malgré la création des aires protégées. Les décideurs pourront s’inspirer des résultats de ce travail pour prendre des mesures idoines de gestion durable des aires protégées du pays. Cette étude est la première réalisée pour examiner les valeurs naturelles et l’impact de conservation des aires protégées burundaises. Elle pose les bases de nouvelles investigations scientifiques orientées vers la conservation de la biodiversité au Burundi.