La présente étude a pour objectif d’analyser les relations entre la disponibilité des espèces et leurs degrés d’utilisation par les populations riveraines de deux aires protégées à l’Est du Burkina Faso (Afrique de l’Ouest). Pour ce faire, une enquête ethnobotanique a été conduite sur les espèces ligneuses offrant au moins un service écosystémique aux populations riveraines du Parc national d’Arly (PNA) et de la Réserve partielle de Faune de Pama Nord (RPFPN). Des Valeurs d’usage par espèce (VUs) ont été calculées puis corrélées (test de Pearson) aux Indices de valeurs d’importance (IVI) fournis par de précédentes études. Quatre vingt cinq (85) espèces ligneuses ont été citées dans les villages riverains au PNA et 82 dans les villages riverains à la RPFPN. Ces espèces offrent 23 types de services écosystémiques à la population locale. Le coefficient de corrélation du test de Pearson entre VUs et IVI est faible (r < 0,5; p < 0,001) dans les deux localités. Les préférences des populations riveraines pour une espèce donnée, ne dépendent pas de sa disponibilité. Ainsi 15 espèces ligneuses vulnérables ont été répertoriées. Des actions doivent alors être engagées pour la restauration de ces espèces ligneuses dans leurs écosystèmes naturels.