La présente étude porte sur l’évaluation du niveau d’altération de la qualité des eaux consommées dans l’arrondissement de Malanhoui, au niveau des sources (Postes d’Eau Autonomes (PEA)) et des ménages. La démarche méthodologique a consisté en un premier temps à faire une enquête afin d’identifier les PEA et d’évaluer le niveau d’hygiène de la population ainsi que les risques encourus. Dans un second temps, des prélèvements d’eau ont été effectués pour l’évaluation de la qualité physico-chimique, chimique et bactériologique. Les données recueillies ont fait l’objet d’une étude statistique en vue d’interprétation. Ces approches stratégiques adoptées ont permis de mettre en lumière la qualité des PEA à Malanhoui. On retrouve une eau globalement de bonne qualité du point de vue physico-chimique et chimique car respectant les normes béninoises. Du point de vue bactériologique, ces eaux présentent globalement des valeurs pour la plupart largement au-delà de la norme. Vu l’exposition de la population aux maladies hydriques, il est opportun de développer en urgence des politiques et stratégies propices afin de remettre à niveau la charge des germes bactériologiques dans les eaux destinées à la boisson à Malanhoui.