Le présent travail est basé sur l’étude de l’évolution de 4 types de bactéries identifiées pendant la phase thermophile du compostage tels que Coliformes fécaux (C.F.), Escherichia coli (E. coli), bactéries anaérobies sulfito-réductrices (ASR), de Pseudomonas aeruginosa (Pseudo. a). Il est aussi focalisé sur la présence de certains microorganismes pathogènes dans le compost fini. Dans cette étude nous avons constaté que Pseudomonas aeruginosa et Escherichia coli ont une population plus faible durant la phase thermophile. En particulier Escherichia coli est inhibé et quasi détruit au cours de cette phase. D’autre part Pseudomonas aeruginosa présente avec une quantité faible et variée, malgré cela la quantité maximale n’excède pas de 580 (UFC) / g. Durant la phase thermophile les coliformes fécaux (C.F) et les Bactéries anaérobies sulfito-réductrices (ASR) se trouvent en quantité faible. Le nombre de C.F a augmenté progressivement juste avant le début de la phase mésophile. On note également la présence de coliformes fécaux et des différentes bactéries comme les bactéries anaérobies sulfito-réductrices, Pseudomonas aeruginosa dans le compost.