L’objectif de cette étude est d’identifier les différents taxons phytoplanctoniques de la zone portuaire d’Abidjan (Côte d’Ivoire), de déterminer leur abondance et d’étudier leur corrélation avec les variables environnementales. Des clés de détermination ont permis d’identifier les principaux groupes d’algues et la méthode d’Utermöhl a permis de les quantifier. Le test non-paramétrique de Spearman a été utilisé pour étudier les relations entre les paramètres environnementaux et l’abondance des taxons. Les résultats ont montré que la flore microalgale de la zone portuaire était composée de 44 taxons regroupés en 5 embranchements, les Bacillariophyta le groupe le plus diversifié avec 22 taxons, les Dinophyta, les Euglenophyta, les Cyanoprocaryota et les Chlorophyta. L’étude quantitative a montré une forte prédominance des Bacillariophyta. Au niveau spatial, un bloom algal a été observé avec plusieurs millions de cellules, au niveau des stations terminal à conteneurs et Zimbabwe pendant la petite saison des pluies. L’étude de la corrélation entre les variables environnementales et les paramètres biotiques a montré que les taxons étudiés sont sous l’influence de la conductivité, la salinité, l’oxygène dissous, la transparence, les nitrites, les silices et les orthophosphates.