Ce travail porte sur la diversité des macroinvertébrés benthiques des miroirs d’eau de crocodiles du Centre de Recherche en Hydrobiologie (CRH/Uvira), en République Démocratique du Congo. Les investigations sont menées entre janvier et juin 2019 et ont permis de mesurer in situ certains paramètres physico-chimiques de l’eau à l’aide d’une sonde multiparamétrique de la marque HANNA HI 98194, pH/ EC/ DO multiparameter et de collecter les échantillons des macroinvertébrés benthiques à l’aide du filet troubleau de 1 mm de diamètre de maille. La diversité des macroinvertébrés a été analysée à partir des indices de Shannon et d’Equitabilité. Les résultats montrent que les valeurs moyennes de ces quelques paramètres (pH, température, oxygène dissous, conductivité électrique, Solides dissous totaux, salinité, saturation et oxydation-réduction potentielle) varient respectivement entre 9,23 et 8,87 ; 25,54 et 25,3 °C; 3,78 et 4,58 ppm ; 271 et 134 µs/cm ; 67 et 128 ppm ; 0,06 et 0,12 PSV; 62,3 et 47,2 % et 16,5 et 3,78 mV. Ainsi, cette étude relève également une faune benthique abondante et diversifiée, repartie en 12 genres, 10 familles, 8 ordres, 3 classes et 4 embranchements. Seule la classe des insectes a représenté le groupe taxonomique le plus abondant (94,32 %). A la tête de cette abondance, le genre Beatis a été plus représentatif (47,93 %.) suivi respectivement de ceux de Chironomus et Pantala (16,59 et 12.60 %). Il a été constaté que 93,39 % des macroinvertébrés capturés étaient au stade larvaire et que les indices de Shannon et d’Equitabilité renseignent que toutes les stations sont diversifiées (H1 = 1.495, H2 = 1.499) et réparties équitablement (E1 = 0.68, E2 = 0.72).