Cette étude a pour objectif d’évaluer la contamination par Salmonella sp. et Vibrio cholerae des eaux de puits consommées dans la ville de Garoua, dans l’optique de prévenir les maladies hydriques causées par ces germes. Des échantillons d’eau ont été collectés, selon une fréquence mensuelle pendant 10 mois, de 23 puits représentatifs de la région d’étude et soumis aux analyses bactériologiques. Les résultats obtenus révèlent que ces eaux, bien que très consommées dans la zone d’étude, ne sont pas toujours de bonne qualité. Ces eaux renferment aussi bien des bactéries fécales pathogènes que celles commensales. Quelques souches de Salmonella sp. ont été isolées dans les puits de certains quartiers de Garoua au cours de l’étude. La contamination des eaux de puits par les salmonelles n’est pas généralisée et est plus accentuée dans les puits des quartiers Ngalbidjé et Base Aérienne. Les sérogroupes OMA et OMB ont été tous les deux représentés à Ngalbidjé. Aux quartiers Poumpoumré et Camp chinois, seul le sérogroupe OMA a été présent ; tandis que les quartiers Roumdé-Adjia, Base Aérienne et Bocklé ne comportent que le sérogroupe OMB. Presque toutes les souches de salmonelles testées ont été sensibles aux antibiotiques habituellement utilisés en clinique dans la zone d’étude. La seule résistance enregistrée concernait la tétracycline pour la souche OMA isolée du puits P7 situé à Poumpoumré. Aucune souche de Vibrio cholerae n’a cependant été isolée au cours de l’étude. Garoua étant une zone où des épidémies de choléra sont souvent déclarées, les bactéries de cette espèce pourraient être présentes dans l’environnement aquatique dans un état viable mais non cultivable ou en association avec d’autres organismes aquatiques.