Oued Sebou est le plus important fleuve se jetant dans l’Atlantique. Son bassin connaît une activité industrielle très développée, ainsi qu’une importante activité domestique et agricole ; d’où la nécessité d’évaluer la qualité de ses eaux. L’intensification de ces activités génère une pollution importante entrainant la dégradation globale de l’habitat ainsi que la raréfaction et la mortalité de la biocénose. Une analyse physico-chimique des eaux a été réalisée et les résultats indiquent que les sites situés à proximité des zones les plus urbanisées et industrialisées sont gravement altérés. En effet, le pH y est faiblement à moyennement alcalin ce qui montrent que les eaux de la majorité des stations étudiées sont très productives à polluées. Les eaux sont excessivement minéralisées et chargées en matière organique, cela se traduit par des valeurs élevées des principaux descripteurs de la pollution organiques (DBO5, MES, PO4 3-, NO2 et NH4+), faible teneur en oxygène dissous et turbidité élevée, ce qui est en relation avec la charge des eaux usées. Cependant, les sites distants montrent des modifications de la composition physique et chimique des eaux. Ainsi, les eaux de la majorité des stations sont qualifiées à la classe médiocre à très mauvaise.