Cette étude a pour objet d’identifier les champignons responsables de la maladie de nécroses racinaires de manioc (CNRD) dans la Province de la Tshopo en RD du Congo. Pour ce faire, une enquête a été réalisée dans trois champs de collection de manioc à savoir celui de WAVE/IFA-Yangambi, de IITA et celui de l’INERA-Yangambi. 30 échantillons de tubercule de manioc présentant les symptômes de nécroses ont été prélevées dans chaque champs de collection et ensuite amenées au Laboratoire de Phytopathologie et Biotechnologie végétales de WAVE/IFA- Yangambi pour être cultivés sur le milieu de culture PDA et faire des études macroscopiques et microscopiques de ces isolats. La sévérité de la maladie de nécroses racinaires de manioc a été obtenues pour les trois champs de collection et se présente de la manière suivante : le champ de collection de WAVE/IFA-Yangambi a une sévérité de 3, le champ de collection de l’IRERA-Yangambi a une sévérité de 2 et celui de IITA en a 2. Les analyses macroscopiques et microscopiques des isolats issus de racines de manioc nécrosées ont permis de mettre en évidence les genres de champignons responsables de cette maladie. Il s’agit de trois différents genres de champignons qui sont : 20 isolats appartenant au genre Fusarium , 28 isolats du genre Phytophtora et 10 isolats du genre Pythium .