La question de gestion des déchets devient de plus en plus une préoccupation importante pour l’ensemble de la communauté internationale. A Zinder, une ville du Niger, la prolifération de dépotoirs sauvages constitue un enjeu majeur de santé pour la population et pour l’environnement. L’objectif de cette étude est de déterminer l’impact des décharges incontrôlées sur la qualité bactériologique des eaux souterraines de la ville de Zinder. Pour cela, l’ensemble des dépotoirs sauvages de la ville ont été répertoriés et cartographiés. Des prélèvements d’échantillons d'eau ont été effectués au niveau des points d’eau qui se situent dans les bas-fonds de la ville. Les prélèvements, le transport et la conservation des échantillons d’eau sont effectués suivant les lignes directrices de l’OMS. Les paramètres bactériologiques ont été déterminés selon les méthodes décrites par Rodier (2009). L’analyse repose sur quelques paramètres indicateurs de la pollution d’origine fécale des eaux. Les indicateurs pris en compte sont les streptocoques fécaux (SF) et les coliformes fécaux (CF). Au total 28 principaux dépotoirs sauvages ont été répertoriés dans la ville de Zinder parmi lesquels 19 au sein de la zone urbaine. Les résultats d’analyse des échantillons des eaux de puits et forages situés dans les bas-fonds de la ville ont montré la présence d’une contamination bactérienne. La contamination en germes pathogènes de ces eaux pourrait constituer un risque sanitaire pour les consommateurs, surtout dans une ville ou le recours aux eaux des puits est très fréquent.