Le phosphate naturel de par sa formule chimique constitue une source importante de l’élément phosphore pour les plantes. Pour cela il est utilisé dans le compost pour améliorer les qualités nutritionnelles des plantes. Les analyses chimiques effectuées sur le phosphate naturel révèlent la présence des métaux lourds. Pour étudier les risques de rétrogradation de ces engrais phosphatés, notre étude s’est portée sur la complexation des substances humiques naturelles extraites des sols sur des ions métalliques tels que le calcium, cadmium et le magnésium contenus dans les phosphates naturels de Hahotoé- Kpogamé du Togo. Les résultats obtenus montrent que la quantité d’ions complexés augment avec le temps d’attaque. Le taux d’ions complexés diminue lorsque le pH de la solution d’acide humique évolue de 6,5 à 9,5. Une étude comparative de la complexation de ces trois ions révèle que le cadmium malgré sa faible teneur dans le phosphate naturel se complexe mieux que le calcium et le magnésium. Après 30 jours d’attaque du phosphate naturel nous avons obtenu un taux avoisinant les 10% pour le cadmium, 9% pour le calcium et environ 2% pour le magnésium pour une solution d’acide humique de pH=6,5.