Dans le but de mieux comprendre l’histoire de l’évolution du cocotier et développer des outils génomiques pour son amélioration, l’établissement de la carte génétique du cocotier a été initié. Le plan de croisement convenu pour produire la population de cartographie est le back cross 1 : NJM x (NJM x GOA + ) où quatre géniteurs issus du croisement NJM x GOA ont été recroisés au NJM. L’objectif de cette étude est de déterminer le degré de similarité entre les géniteurs utilisés dans ce croisement. Cela permettra de s’assurer de l’efficacité du croisement pour l’établissement de la carte génétique vu que chez les espèces allogames, il est difficile d’obtenir des populations homogènes. Pour cela les plants (descendants) issus de 120 noix semences, dont 64 sont issues des 4 géniteurs impliqués dans le BC1 et 56 récoltées sur 3 témoins NJM, PB121 + , et GOA ont été utilisés. Cinq variables ont été mesurées sur différentes périodes de croissance au germoir et à la pépinière. Sur l’ensemble des caractères morphologiques mesurés au germoir et à la pépinière, seule la circonférence au collet a été le descripteur plus pertinent. Elle a permis de mettre en évidence que la population constituée par les 4 géniteurs est une population homogène, une similarité entre eux a été montrée. Ces géniteurs issus du croisement NJM X GOA ont eu une plus grande affinité avec le NJM. Cette étude a aussi montré que l’expression du nanisme ne s’observe qu’à partir de 844 jours après la mise en germoir.