L’action néfaste de certains pesticides sur l’environnement et les organismes aquatiques après leur usage dans les activités agricoles, s’observe dans tous les pays. Cette étude, menée de février 2014 à janvier 2015, porte sur l’évaluation des niveaux de contamination, la répartition des pesticides dans les stations et le statut écologique des sédiments. Les analyses ont été effectuées par chromatographie en phase gazeuse couplée à un spectromètre de masse (CPG/SM) après purification par chromatographie d'adsorption sur cartouche au florisil précédée par l’Extraction par Solvant Accélérée (ASE). Les quatorze (14) pesticides détectés appartiennent à la famille chimique des triazines, des urées substituées, des carbamates, des convulsivants, des organophosphorés et des organochlorés. L’Analyse en Composante Principale (ACP) a indiqué que Taboth (secteur IV) Mopoyem et Gboubo (secteur V) sont les stations les plus contaminées avec la valeur la plus élevée pour la simazine 5203,66 µg / kg à Taboth. La majorité des pesticides quantifiés sont supérieurs aux Normes de Qualité Environnementale (NQE) recommandées par la Communauté internationale. Les sédiments de notre zone d'étude ont un mauvais statut écologique.